Plateforme analytique de l'UMR SVQV

Une plateforme d'analyse pour : 

• identifier et caractériser les facteurs déterminants de la qualité des raisins et des vins
• rechercher, identifier et caractériser les métabolites de défense de la vigne
• réaliser des analyses métabolomiques ciblées ou globales dans le cadre de collaborations avec des partenaires scientifiques nationaux et internationaux

Les équipements

• deux appareils de chromatographie en phase gazeuse couplés à des spectromètres de masse et équipés d’automates injecteur/échantillonneur, dédiés à l’analyse des métabolites volatils. L’un des appareils est équipé d’un détecteur olfactométrique pour la caractérisation des arômes des raisins et des vins. La technique olfactométrique consiste à utiliser le nez humain comme détecteur sensoriel en complément de la spectrométrie de masse, pour identifier et caractériser les molécules odorantes.
• une chaîne de chromatographie liquide UHPLC Thermo Vanquish couplée à un spectromètre de masse à haute résolution Thermo Exploris 120 (technologie Orbitrap) pour l’analyse des composés non volatils.

Les équipements de cette plateforme ont été acquis grâce à des financements d’INRAE (CNOC et département BAP), de l’Université de Strasbourg, de l’Institut de Biologie Moléculaire des Plantes (IBMP), de l’Agence Nationale de la Recherche (ANR), du Comité National des Interprofessions des Vins à Appellation d'Origine (CNIV), de Colmar Agglomération, de la Région Grand Est et de l’Union Européenne.

Dernières publications

• Olazcuaga, L. et al. Metabolic consequences of various fruit-based diets in a generalist insect species. eLife 12, e84370 (2023). https://doi.org/10.7554/elife.84370
• Platel, R. et al. Deciphering immune responses primed by a bacterial lipopeptide in wheat towards Zymoseptoria tritici. Frontiers in Plant Science 13, 1074447 (2023). https://doi.org/10.3389/fpls.2022.1074447
• Koutouan, C., Emmanuel et al. Co-Localization of Resistance and Metabolic Quantitative Trait Loci on Carrot Genome Reveals Fungitoxic Terpenes and Related Candidate Genes Associated with the Resistance to Alternaria dauci. Metabolites 13, 71 (2023).
• Flubacher, N. et al. The fungal metabolite 4‐hydroxyphenylacetic acid from Neofusicoccum parvum modulates defence responses in grapevine. Plant, Cell and Environment (2023). https://doi.org/10.1111/pce.14670
• Rodrigues, M. et al. (2023) Metabolic and Molecular Rearrangements of Sauvignon Blanc (Vitis vinifera L.) Berries in Response to Foliar Applications of Specific Dry Yeast. Plants,12,3423. https://doi.org/10.3390/plants12193423
• Allario, T. et al. Analysis of defense-related gene expression and leaf metabolome in wheat during the early infection stages of Blumeria graminis f.sp. tritici. Phytopathology (2023). https://doi.org/10.1094/PHYTO-10-22-0364-R
• Schilling, M. et al. Wood degradation by Fomitiporia mediterranea M. Fischer: Physiologic, metabolomic and proteomic approaches. Frontiers in Plant Science 13, 988709 (2022). https://doi.org/10.3389/fpls.2022.988709
• Platel, R. et al. Bioinspired Rhamnolipid Protects Wheat Against Zymoseptoria tritici Through Mainly Direct Antifungal Activity and Without Major Impact on Leaf Physiology. Frontiers in Plant Science 13, 878272 (2022). https://doi.org/10.3389/fpls.2022.878272
• Negrel, L. et al. Comparative Metabolomic Analysis of Four Fabaceae and Relationship to In Vitro Nematicidal Activity against Xiphinema index. Molecules 27, 3052 (2022). https://doi.org/10.3390/molecules27103052
• Koschmieder, J. et al. Color recycling: metabolization of apocarotenoid degradation products suggests carbon regeneration via primary metabolic pathways. Plant Cell Reports 41, 961 - 977 (2022). https://doi.org/10.1007/s00299-022-02831-8
• de Borba, M. et al. A Laminarin-Based Formulation Protects Wheat Against Zymoseptoria tritici via Direct Antifungal Activity and Elicitation of Host Defense-Related Genes. Plant Disease 106, 1408-1418 (2022). https://doi.org/10.1094/pdis-08-21-1675-re