Serveur informatique

Un serveur informatique pour le traitement de grands jeux de données de :

• génomique (assemblage de génome, reséquençage, transcriptomique…)
• génétique quantitative (génotypage, carte génétique, détection de QTL…)
• métabolomique (analyses ciblées ou non ciblées en GC et LC-MS)

Equipement :

• Cluster de 5 noeuds
• 162 CPU
• 1,5To de RAM
• 90To d’espace de travail

Ressources en ligne

Moretto M, Navarro-Payá D, Santiago A, Orduña L, Velt A, Rustenholz C*, Matus JT*. GRAPEDIA: The Grapevine Genomics Encyclopedia, an innovative portal to integrate knowledge, resources and services for the grape scientific community and industry. https://grapedia.org

Velt A, Renault L, Arista G, Russell P, Duchêne É, Hugueney P, Rustenholz C. GREAT, GRapevine Expression ATlas: all in one, a curated database, an analysis workflow and a web application to analyze Vitis vinifera public RNA-seq data. https://great.colmar.inrae.fr

Le serveur informatique a été cofinancé par les départements Biologie et Amélioration des Plantes (BAP) et Santé des Plantes et Environnement (SPE) de INRAE, l’Université de Strasbourg, l’Agence nationale de la recherche (ANR) et la Fondation Jean Poupelain.