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Research Gate : https://www.researchgate.net/profile/Eric-Duchene

ORCID : https://orcid.org/my-orcid?orcid=0000-0003-2712-1892

Projet de recherche : imaginer et construire les phénotypes du futur

En sus de mes responsabilités de directeur d'unité, mes recherches visent à de produire des connaissances permettant de construire des variétés de vigne aptes à la production de vins de qualité dans un contexte de changement climatique.

La production viticole est très sensible aux conditions climatiques, ce qui se matérialise par la notion de millésime, spécifique à cette culture. D’une part, anticiper l’adaptation est crucial car la diffusion de nouvelles variétés est un processus lent et fortement décalé dans le temps par rapport au croisement initial, et celles-ci sont appelées à être plantées pour 25 à 30 ans. D’autre part, l'évaluation des génotypes pour leurs aptitudes œnologiques en conditions réelles de production est un processus long et coûteux : se doter d’outils permettant de trier rapidement et efficacement pour ces caractères, en plus d’une sélection sur les résistances aux maladies fongiques, est essentiel. Je coordonne un programme sur le déterminisme génétique de la qualité des raisins prenant en compte les conséquences des changements climatiques. L’objectif est de comprendre les bases génétiques de la composition en arômes et précurseurs d’arômes, en sucres et en acides des variétés de vigne, mais aussi de pouvoir anticiper comment ces paramètres évolueront dans le contexte climatique du futur. L’idée est de proposer au sélectionneur des profils génétiques vers lesquels tendre (idéotypes), des caractères prioritaires à intégrer dans les programmes de création variétale mais aussi les outils moléculaires associés à ces caractères.

Publications représentatives

• Chedid E, Avia K, Dumas V, Ley L, Reibel N, Butterlin G, Soma M, Lopez-Lozano R, Baret F, Merdinoglu D, Duchêne E (2023) LiDAR Is Effective in Characterizing Vine Growth and Detecting Associated Genetic Loci. Plant Phenomics 5 10.34133/plantphenomics.0116
• Gomès É, Maillot P, Duchêne É (2021) Molecular Tools for Adapting Viticulture to Climate Change. Frontiers in plant science 12 10.3389/fpls.2021.633846
• Duchêne E, Dumas V, Butterlin G, Jaegli N, Rustenholz C, Chauveau A, Berard A, Le Paslier MC, Gaillard I, Merdinoglu D (2020) Genetic variations of acidity in grape berries are controlled by the interplay between organic acids and potassium. Theor Appl Genet 133: 993-1008 10.1007/s00122-019-03524-9.
• Zhang C, Dai Z, Ferrier T, Orduna L, Santiago A, Peris A, Wong DCJ, Kappel C, Savoi S, Loyola R, Amato A, Kozak B, Li M, Liang A, Carrasco D, Meyer-Regueiro C, Espinoza C, Hilbert G, Figueroa-Balderas R, Cantu D, Arroyo-Garcia R, Arce-Johnson P, Claudel P, Errandonea D, Rodriguez-Concepcion M, Duchêne E, Huang SC, Castellarin SD, Tornielli GB, Barrieu F, Matus JT (2023) MYB24 orchestrates terpene and flavonol metabolism as light responses to anthocyanin depletion in variegated grape berries. The Plant CellI,  10.1093/plcell/koad228.
• Velt, A., Frommer, B., Blanc, S., Holtgrawe, D., Duchêne, E., Dumas, V., Grimplet, J., Hugueney, P., Kim, C., Lahaye, M., Matus, J.T., Navarro-Paya, D., Orduna, L., Tello-Ruiz, M.K., Vitulo, N., Ware, D., and Rustenholz, C. (2023) An improved reference of the grapevine genome reasserts the origin of the PN40024 highly homozygous genotype. G3 (Bethesda) 13.Maillot P, Velt A, Rustenholz C, Butterlin G, Merdinoglu D, Duchêne E (2021) Alternative splicing regulation appears to play a crucial role in grape berry development and is also potentially involved in adaptation responses to the environment. BMC Plant Biol 21: 487 10.1186/s12870-021-03266-1.
• Ollat N, Zito S, Richard Y, Aigrain P, Brugière F, Duchêne E, Garcia de Cortazar-Atauri I, Gautier J, Giraud Héraud E, Hannin H, Touzard J-M, Bois B (2021) La diversité des vignobles français face au changement climatique : simulations climatiques et prospective participative. Climatologie 18 10.1051/climat/202118003.
• Poni S, Gatti M, Palliotti A, Dai Z, Duchêne E, Truong T-T, Ferrara G, Matarrese AMS, Gallotta A, Bellincontro A, Mencarelli F, Tombesi S (2018) Grapevine quality: A multiple choice issue. Scientia Horticulturae 234: 445-462 10.1016/j.scienta.2017.12.035.
• Savoi S, Arapitsas P, Duchêne E, Nikolantonaki M, Ontanon I, Carlin S, Schwander F, Gougeon RD, Ferreira ACS, Theodoridis G, Topfer R, Vrhovsek U, Adam-Blondon AF, Pezzotti M, Mattivi F (2021) Grapevine and Wine Metabolomics-Based Guidelines for FAIR Data and Metadata Management. Metabolites 11: 757;  10.3390/metabo11110757.

Chapitre de livre

Vigne, Vin et Changement climatique. Chapitre 5 - Idéotypes de vigne pour l'adaptation au changement climatique. Coord N.Ollat et J.M. Touzard. Éditions QUAE. Parution le 7 mars 2024.

Coordinations

VitisExplorer : Pilotage du projet visant à centraliser et à exploiter les données phénotypiques de plus de 2000 génotypes de vignes résistants aux maladies fongiques  actuellement en cours d'évaluation en France.

AgroEcoPhen : Pilotage avec David Rousseau (Université d'Angers) et Morgane Roth (INRAE Avignon) de la tâche consacrée à la mise en œuvre d'outils de phénotypage de la vigne et des arbres fruitiers en conditions naturelles.

SOERE TEMPO : Animation avec Agnès Destrac-Irvine (INRAE Bordeaux) de l'observatoire vigne du projet.

Parcours

• 2023 : Directeur de l'UMR Santé de la Vigne et Qualité du Vin
• 2017 : Habilitation à diriger des recherches de l'Université de Strasbourg. "Déterminants génétiques de la composition des baies de raisins : Application à la création variétale dans le cadre du changement climatique"
• 2015: Doctorat de l'université de Strasbourg " Une exploration des possibilités génétiques pour l'adaptation de la vigne au changement climatique".
• 1996 : Entrée à INRAE
• 1991-1996 : Arvalis Institut du Végétal - 91- Boigneville - responsable national des recherches sur l'écophysiologie des protéagineux.
• 1987 : Diplôme d'ingénieur agronome AgroParisTech